Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CROTQ9UKG9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms