Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLKQ9UBT6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms