Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SAE1Q9UBE0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms