Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RRBP1Q9P2E9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms