Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT84Q9NSB2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT84Q9NSB2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms