Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FBXO8Q9NRD0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms