Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ASCL3Q9NQ33 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms