Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ZCCHC2Q9C0B9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms