Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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KRTAP1-5Q9BYS1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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