Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HERPUD2Q9BSE4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERPUD2Q9BSE4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms