Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TEFMQ96QE5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TEFMQ96QE5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TEFMQ96QE5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms