Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC136Q96JN2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms