Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF428Q96B54 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms