Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RABGGTAQ92696 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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RABGGTAQ92696 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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