Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
POMGNT2Q8NAT1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms