Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PARP9Q8IXQ6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PARP9Q8IXQ6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms