Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM5Q71RC9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM5Q71RC9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms