Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPOCD1Q6ZMY3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms