Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EDC4Q6P2E9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDC4Q6P2E9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms