Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EEF1DP3Q658K8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms