Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAMD13Q5VXD3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms