Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KNOP1Q1ED39 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KNOP1Q1ED39 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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