Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DDR2Q16832 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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