Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCL15Q16663 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCL15Q16663 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms