Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPE65Q16518 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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