Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 419.02■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.968e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.378e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 YWHAZ-207ENST00000395958 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.628e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.758e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 NCLN-208ENST00000592737 2735 ntTSL 316.65■□□□□ 0.266e-10■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 NCLN-206ENST00000591062 460 ntTSL 513.78□□□□□ -0.26e-10■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 STXBP1-210ENST00000627871 538 ntTSL 317.89■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 STXBP1-213ENST00000630492 572 ntTSL 517.78■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 STXBP1-220ENST00000637521 2068 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 STXBP1-206ENST00000625363 550 ntTSL 49.09□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-208ENST00000588918 2040 ntTSL 524.87■■□□□ 1.572e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.572e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.552e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-207ENST00000588626 525 ntTSL 316.88■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-212ENST00000591878 557 ntTSL 515.05■□□□□ -02e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 PEX19-205ENST00000472750 3504 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -11e-9■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 PEX19-204ENST00000467711 205 ntTSL 37.81□□□□□ -1.161e-9■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-9■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 16e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.736e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.366e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.216e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DMPK-206ENST00000588522 2920 ntTSL 515.88■□□□□ 0.136e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 220.23■□□□□ 0.835e-11■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 ZNF787-201ENST00000586787 386 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.466e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 217.29■□□□□ 0.366e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SMG7-203ENST00000367538 328 ntTSL 216.94■□□□□ 0.36e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RECQL4-205ENST00000532846 1055 ntTSL 516.65■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-202ENST00000394241 568 ntTSL 315.43■□□□□ 0.066e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 515.38■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 215.04■□□□□ -05e-11■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.096e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SMG7-210ENST00000502375 566 ntTSL 514.46□□□□□ -0.096e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 214.22□□□□□ -0.136e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.175e-11■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC13□□□□□ -0.336e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 CCDC138-202ENST00000409529 2364 ntTSL 212.92□□□□□ -0.346e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 CCDC138-201ENST00000295124 2383 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.396e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.396e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SDF4-203ENST00000403997 728 ntTSL 312.43□□□□□ -0.425e-11■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-209ENST00000554930 1377 ntTSL 511.86□□□□□ -0.516e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-207ENST00000450929 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.526e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.596e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-208ENST00000460808 470 ntTSL 411.21□□□□□ -0.616e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 TGFA-203ENST00000418333 1225 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.646e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 ZNF827-201ENST00000379448 4197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.656e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SMG1P3-205ENST00000522480 4262 ntBASIC10.52□□□□□ -0.735e-11■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 ZNF827-208ENST00000513320 3165 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.766e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-202ENST00000396294 6258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.886e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-211ENST00000556451 2282 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.086e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.096e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.186e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.366e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-210ENST00000555870 7434 ntTSL 1 (best)5.7□□□□□ -1.56e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.586e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-207ENST00000553349 700 ntTSL 34.47□□□□□ -1.696e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 CCDC138-205ENST00000456512 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.21□□□□□ -1.746e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.896e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-214ENST00000556940 485 ntTSL 32.43□□□□□ -2.026e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.086e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 R3HDM2-208ENST00000448732 195 ntTSL 1 (best)21.45■■□□□ 1.024e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.334e-6■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 WDR20-215ENST00000558448 611 ntTSL 39.66□□□□□ -0.861e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 WDR20-218ENST00000559478 422 ntTSL 29.54□□□□□ -0.881e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 WDR20-208ENST00000555973 560 ntTSL 48.92□□□□□ -0.981e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 WDR20-214ENST00000558135 585 ntTSL 25.78□□□□□ -1.481e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 WDR20-219ENST00000559708 563 ntTSL 35.71□□□□□ -1.51e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 WDR20-217ENST00000558854 532 ntTSL 24.63□□□□□ -1.671e-8■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SEPT8-203ENST00000371493 562 ntTSL 411.78□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 24.9
PCBP2Q15366 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 49.09□□□□□ -0.956e-8■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-12■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-12■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 PIK3R2-202ENST00000426902 3273 ntTSL 216.89■□□□□ 0.292e-12■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 325.24■■□□□ 1.634e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 225.24■■□□□ 1.634e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 521.04■□□□□ 0.964e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CELSR2-203ENST00000489018 2958 ntTSL 511.89□□□□□ -0.519e-9■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.344e-7■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.384e-7■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 ARHGEF18-205ENST00000599752 582 ntTSL 318.81■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 JMY-202ENST00000412001 409 ntTSL 36.04□□□□□ -1.443e-6■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.57e-12■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.665e-7■■■■□ 24.8
PCBP2Q15366 CNOT4-212ENST00000541284 3563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.95e-7■■■■□ 24.8
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