Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDGFRLQ15198 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDGFRLQ15198 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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