Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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