Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RFTN1Q14699 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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