Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BECN1Q14457 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BECN1Q14457 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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