Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCARF1Q14162 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCARF1Q14162 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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