Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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PDE7AQ13946 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PDE7AQ13946 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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