Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLF9Q13886 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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