Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PKP1Q13835 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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PKP1Q13835 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PKP1Q13835 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PKP1Q13835 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PKP1Q13835 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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