Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKD2Q13563 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PKD2Q13563 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
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