Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP4Q13115 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP4Q13115 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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