Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC173Q0VFZ6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC173Q0VFZ6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms