Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UBXN1Q04323 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms