Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLOD1Q02809 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLOD1Q02809 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms