Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYP27A1Q02318 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CYP27A1Q02318 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms