Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BNC1Q01954 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms