Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MC1RQ01726 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms