Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MYBPC1Q00872 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms