Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FGD1P98174 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FGD1P98174 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FGD1P98174 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FGD1P98174 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms