Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
ROMO1P60602 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms