Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
LINC01547P58512 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms