Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC12A2P55011 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms