Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB28P51157 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB28P51157 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB28P51157 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms