Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ME1P48163 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ME1P48163 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ME1P48163 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ME1P48163 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ME1P48163 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ME1P48163 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ME1P48163 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ME1P48163 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ME1P48163 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ME1P48163 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms