Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCKBRP32239 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCKBRP32239 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms